Son sus principales objetivos:

Realizar investigaciones sobre la realidad social, política, económica y cultural del país, que reviertan en un mayor conocimiento de aquellos problemas referidos a la generación de políticas o programas de acción, orientados al mejoramiento de las condiciones de vida de los diferentes grupos sociales, con preferencia los menos favorecidos.

Estudiar los problemas propios de la construcción de un nuevo orden social, político, económico y cultural democráticos, vinculados a la construcción de espacios de autogobierno local en le marco del desarrollo autosostenible.

Mantener permanentes relaciones de diálogo con diferentes actores sociales y organizaciones o grupos de base, con el objetivo de compartir espacios de reflexión y coordinar acciones conjuntas orientadas al mejoramiento integral de la calidad de vida y del desarrollo del país.

Desarrollar actividades de apoyo a los grupos sociales menos favorecidos, en la formulación de proyectos, acompañamiento, seguimiento y evaluación de los mismos, como aplicación de la investigación a los fines del desarrollo social.

Mantener intercambio con investigadores e instituciones académicas de América Latina y el resto del mundo, que desarrollan tareas en áreas afines a las desarrolladas por BASE-IS.

Participación en redes nacionales y asociaciones internacionales

La presencia de BASE-IS a nivel nacional viene siendo relativamente amplia. Geográficamente se ha estado trabajando en seis Departamentos de la Región Oriental del país y en uno de la Región Occidental o Chaco. Los contactos con organizaciones campesinas están centrados en varios de ellos, con cobertura regional, y en otros puntos dispersos.

Se tiene presencia asimismo en organizaciones de pobladores urbanos, especialmente de Asunción, con grupos de jóvenes y con grupos de mujeres, tanto en la capital como en el interior. BASE-IS forma parte de tres redes nacionales: REDRURAL (Red de ONGs dedicadas a la Investigación y Promoción del Sector Rural), CODEHUPY (Coordinadora de Derechos Humanos del Paraguay) y POJOAJU (Asociación de ONG's del Paraguay). Mantiene además contactos permanentes con organizaciones campesinas, sindicales y juveniles.